تتولى مديرية الرقابة الداخلية :
1. تمكين الإدارة من الإحاطة بكيفية سير الأعمال في الجهات  التابعة لها وضمن الولاية العامة للهيئة المركزية للرقابة والتفتيش بما يكشف عن مواطن الخلل والهدر وأسباب قصور الإنتاج ودواعي عدم كفاية تنفيذ الخطط .

2. اقتراح أساليب تطوير العمل وزيادة الفعالية والإنتاج.

3. مؤازرة الهيئة المركزية للرقابة والتفتيش في أداء مهماتها والتعاون مع البعثات التحقيقية والتفتيشية للهيئة والجهاز للرقابة المالية .

4. تحقيق بالمخالفات الإدارية  والمسلكية ، وبشكاوى المواطنين .

5. وضع اليد على مايتعلق بالجرائم الاقتصادية وسائر المخالفات والجرائم الواقعة على المال العام والمرتكبة من قبل العاملين في الجهات التابعة لها والتحفظ على وقائعها وأدلتها إلى حين مباشرة الجهات المختصة تحقيقها .

6. تنفيذ أعمال رقابية وتفتيشية محددة من خلال خطط عمل سنوية أو طارئة تضعها الإدارة بالاتفاق مع الهيئة.

7. رفع تقارير التحقيق أو الرقابة والتفتيش إلى المدير العام تمهيدا لإرسالها إلى الهيئة المركزية للرقابة والتفتيش مشفوعة برأيه.

8. تعتبر تقارير مديرية الرقابة الداخلية بمختلف إشكالها وبعد اعتمادها من رئاسة الهيئة المركزية للرقابة والتفتيش مماثلة لتقارير الهيئة ويتم التعامل معها من قبل إدارة الشركة بنفس الطريقة التي يتم التعامل بها مع تقارير الهيئة المركزية للرقابة والتفتيش.